圣猶達兒童研究醫院的科學家揭示了兩種帕金森病相關蛋白的復雜結構,這兩種蛋白都與晚發性病例有關。富亮氨酸重復激酶2 (LRRK2)是一種在磷酸化過程中修飾其他蛋白質的蛋白激酶,Rab29是Rab GTP酶家族的成員,它調控著細胞的運輸,并調節著LRRK2的活性。目前還不清楚Rab29和LRRK2是如何協同作用導致帕金森病的。圣猶達大學的研究人員確定了與Rab29結合的LRRK2的結構,揭示了LRRK2調控背后的奧秘,并提出了對藥物設計有意義的見解。
這項研究成果發表在《科學》(Science)雜志上。
帕金森病是僅次于阿爾茨海默病的第二大常見神經退行性疾病,65歲以上的老年人口中有1-2%的人患有該病。眾所周知,帕金森病與遺傳有關,約15%的病例有家族史。雖然與該疾病相關的基因有很多,但LRRK2突變是最常見的原因之一。由于LRRK2 體積龐大,LRRK2的結構研究一直很麻煩。
圣猶達大學結構生物學系通訊作者Ji Sun博士說:“這種蛋白質的研究極具挑戰性。”
盡管困難重重,Ji Sun和他的團隊還是2021年在Cell上發表了全長LRRK2的第一個結構。
“在第一篇論文中,我們得到了LRRK2的結構,但該結構顯示出非活性構象,”Ji Sun解釋說。蛋白質通常有活躍和不活躍的形式,由不同的細胞信號調節。有時,它需要與另一種蛋白質結合才能觸發結構變化,使蛋白質從非活性形狀變為活性形狀。“所以,我們開始思考,‘我們有LRRK2的一個關鍵狀態。我們能得到它的活性構象嗎?’”
冷凍電鏡捕捉到LRRK2的活性狀態
尋找活性構象并不像將Rab29添加到LRRK2中那么簡單。LRRK2 可以與其他 LRRK2 分子結合,這一過程稱為寡聚化。這可以將單個LRRK2單體(一個單元)轉化為二聚體(兩個單元),甚至更大的組裝體。這意味著研究人員必須尋找代表活性形式的版本。還有一個問題是Rab29位于細胞膜上。
“在細胞中,大約90%或更多的LRRK2是細胞質,”Sun解釋說,指的是細胞質,細胞膜包裹的液體,含有細胞的許多成分。“非常少量位于膜表面并形成大的低聚物。這些都是活躍的和功能性的版本。”
文章第一作者,St. Jude結構生物學系的Hanwen Zhu博士,使用低溫電子顯微鏡確定了Rab29-LRRK2復合物的第一個結構。這包括單體(一對)和二聚體(兩對)的結構,以及意想不到的四聚體(四對)。“我們對這些結構發現感到非常興奮,因為它們代表了第一個在活躍狀態下捕獲的高分辨率LRRK2結構”。
Sun補充說:“在這個四聚體中,我們看到了LRRK2的活性構象,但在單體和二聚體復合物中,LRRK2處于非活性構象。”
了解Rab29-LRRK2復合物
這些發現表明,LRRK2的激活不僅取決于與之相互作用的蛋白質,還取決于它們在細胞內的空間排列。
“我們提出了從單體到四聚體在膜募集的過渡,在細胞內,它主要是LRRK2的非活性單體或二聚體。但當Rab29將LRRK2招募到膜上時,LRRK2的局部濃度增加。這促進了向四聚體的轉變,其中LRRK2變得活躍。”
這對帕金森病有什么影響?這些結構為研究人員提供了一個原子尺度的地圖,追蹤導致帕金森病的不同突變如何影響該復合體的功能。
Sun說:“所有這些突變實際上都有利于活性構象,這意味著它們在活性構象中提供新的相互作用,或者破壞非活性構象中的相互作用。”“突變的影響可以在我們的結構中漂亮地可視化:它解釋得很好。”
這種結構研究的重要性不僅在于獲得的新見解,還在于它們在藥物設計中的潛在應用。例如,研究人員還捕獲了藥物DNL201存在時LRRK2的結構。這種藥物通過了第一階段的臨床試驗,將蛋白質鎖定在活性狀態,因此它被用來驗證他們的發現,即四聚體確實是復合物的活性形式。
“我們現在有一個不活躍的構象和一個活躍的構象,所以我們可以監測從不活躍到活躍狀態的轉變,這些結構為藥物化學家設計用于治療帕金森病的新型LRRK2抑制劑提供了急需的見解。”
(文章來源:www.ebiotrade.com/newsf/2023-12) |