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                              Nano BRET?技術研究活細胞中蛋白質的相互作用
                              [ 發布日期:2023-6-29 8:52:11    閱讀次數:573 ]

                              簡介

                                   蛋白質之間的動態相互作用是多種細胞功能的關鍵媒介,幾乎與所有的生物過程都相關。因此,它們是研發新型藥物治療的有價值靶點。在這種背景下,Promega開發的生物發光共振能量轉移(BRET)是一種成熟的檢測技術,用于研究活細胞中的蛋白質相互作用。然而,由于其有限的動態范圍和靈敏度,其應用推廣至今仍受到一定的阻礙。

                                      隨著最新的極其明亮的NanoLuc®熒光素酶的出現,用其與一種帶有長波長熒光團的細胞內蛋白質結合的標記方法, P r o m e g a 將B R E T 技術帶到了一個新的水平:NanoBRET™。

                                      由于其尺寸?。?9 kDa)、發射強度高且光譜(460nm峰值強度)相對狹窄,NanoLuc®熒光素酶成為理想的能量供體。一種高效紅光發光受體熒光團(635nm峰值強度)使整個BRET光譜分離超過175nm(見圖1)。相比其他BRET分析技術,它整合了更大的光強度與改進的光譜分辨率,因此顯著提高了檢測結果的靈敏度,并使其達到了更高的動態范圍 [1]

                                         

                                      NanoBRET™靶位結合細胞內HDAC試驗,測試的是完整細胞內可與選定目標HDAC蛋白結合的化合物的親和力,該化合物可競爭性地取代細胞中與NanoLuc®融合蛋白可逆結合的NanoBRET™示蹤劑。隨著最新的極其明亮的NanoLuc®熒光素酶的出現,用其與一種帶有長波長熒光團的細胞內蛋白質結合的標記方法, P r o m e g a 將B R E T 技術帶到了一個新的水平:NanoBRET™。

                                      在試驗的第一步,向表達所需NanoLuc®融合蛋白的細胞中加入固定濃度的示蹤劑。競爭性化合物的引入導致NanoBRET™能量轉移的劑量依賴性下降,以此估計靶蛋白的胞內親和力。NanoBRET™TE細胞內HDAC試驗評估化合物與組蛋白去乙?;福℉DAC)—NanoLuc熒光素酶融合蛋白[2]的結合。在本應用指南中,我們在Spark多功能酶標儀上演示了用于評估化合物與HDAC6(一種與癌細胞轉移和腫瘤發生相關的組蛋白去乙?;福┙Y合的方法。

                                    

                                         

                                      Spark酶標儀是Tecan公司的多模塊檢測平臺,可為基于發光的檢測應用提供卓越的性能,包括閃光和輝光發光、多色發光和發光掃描[3,4]。專用光電倍增管(PMT)允許單光子計數,消除了通常與使用單個PMT進行熒光和發光測量的儀器相關聯的靈敏度和動態范圍之間的沖突。這種獨特的光學組合成就了優越的靈敏度,可與獨立的光度計相媲美。該酶標儀配備了專門針對NanoBRET應用的優化升級款發光濾片。

                                      本應用指南總結了使用Spark酶標儀和NanoBRET檢測技術實施NanoBRET™靶位結合細胞內HDAC試驗的一系列測試結果。

                              材料和方法

                              • HEK293細胞穩定表達HDAC6-NanoLuc®融合蛋白
                              • NanoBRET™ TE細胞內HDAC檢測試劑盒(Promega,Cat# N2080)
                              • 包括NanoBRET™Nano-Glo®底物,示蹤稀釋緩沖液,NanoBRET™細胞內TE HDAC示蹤劑,和細胞外NanoLuc®抑制劑
                              • Opti-MEM® I減血清培養基,無酚紅(Fisher, cat#11058021)
                              • SAHA (亞?;桨妨u肟酸)/ Vorinostat(Sigma, cat#
                              SML0061, 配制為10mM DMSO原液)
                              • Panobinostat (Selleck Chemicals, cat# S1030, 配制為10mMDMSO原液)
                              • Costar® #3917 96孔白色帶蓋組織培養處理板(Fisher, cat#07-Spark-628)
                              • 各種單通道和多通道移液器和槍頭,移液槽

                                      將HEK293細胞穩定表達HDAC6-NanoLuc®融合蛋白在不含血清或酚紅的Opti-MEM培養基中重懸至密度為2x105個/mL。將85μl的細胞懸液(17,000個細胞/孔)轉移到康寧實驗板的孔中。將80 μl的NanoBRET™細胞內TE HDAC示蹤劑和320 μl的示蹤稀釋緩沖液結合制成20X NanoBRET™示蹤劑,在所有實驗孔中加入5 μl的NanoBRET™示蹤劑。 

                                       將10mM原液含有Panobinostat和亞?;桨妨u肟酸(SAHA)測試化合物在Opti-MEM中稀釋至200 μM,然后在Opti-MEM中按1:3連續滴定,形成10X濃度11-pt劑量反應滴定。將稀釋后的化合物10 μl一式三份加入實驗孔中。不含化合物的對照孔中也添加10 μl培養基。

                                      將檢測板以700轉/分的速度混勻振蕩15秒,然后置于37°C/5% CO2培養箱中孵育85分鐘。 

                                      孵育后,將測定板從培養箱中取出,使其在室溫下平衡15分鐘。

                                      在室溫平衡過程中,將30 μl的NanoBRET™Nano-Glo®底物和10 μl的胞外NanoLuc®抑制劑與4.96 ml不含血清或酚紅的Opti-MEM結合制成3X完整底物加抑制劑溶液。在所有實驗孔中加入50μl 該3X完整底物加抑制劑溶液。

                                      將檢測板以700轉/分的速度混勻振蕩15秒,然后在室溫下孵育2分鐘,然后測量NanoBRET。 

                                      根據試劑盒說明書[2]制備NanoBRET TE細胞內HDAC檢測試劑盒并移液到Costar白色96孔平底微孔板中,總檢測量為150 μl。在In nite Spark上進行檢測的參數設置如表1所示。

                                          

                              結果和討論

                                      使用Spark對每個微孔依次讀取供體和受體波長。手工計算BRET比值,將比值結果乘以1000轉換為milliBRET單位(mBU)。

                               

                                      已知的HDAC抑制劑Panobinostat和SAHA都會與HDAC6結合,導致BRET比值的劑量依賴性變化。高濃度的兩種化合物取代了細胞內的HDAC示蹤劑,導致BRET[3]降低。測得Panobinostat和SAHA的EC50值分別為1.42 μM和0.54 μM(見圖3)。隨著藥物濃度的稀釋,對示蹤劑結合的競爭變得不那么明顯。較低濃度的化合物取代較少的示蹤劑,使得供體NanoLuc®熒光素酶和示蹤劑之間發生能量轉移。

                                           

                                      總之,供體(NanoLuc®熒光素酶)和受體(示蹤劑)的發光信號過濾后的波長均可被檢測到。因此,Spark多功能酶標儀是適用于NanoBRET™檢測的。

                                           

                              參考文獻

                                      1) Machleit et al. NanoBRET–A novel BRET platform for

                              the analysis of protein-protein interactions. ACS Chem.

                              Biol., 2015, 10 (8), pp 1797–1804

                                      2) NanoBRET™ Target Engagement Intracellular HDAC

                              Assay. Technical Manual/Instructions for Use. 6/16,

                              TM483 (Promega)

                                      3) Unparalleled flexibility for luminescence detection wit h

                              the Spark™ multimode reader. Technical Note. 398597

                              V2.0. 01-2017 (Tecan)

                                      4) Spark® multimode reader - luminescence sensitivity.

                              Optimizing the detection limits for flash and glo w

                              luminescence. Technical Note. 398751 V2.0. 01-2 017

                              (Tecan)

                                      5) Implementation of NanoBRET assay technology the

                              Infinite 200. Application Note. 400193 V1.0 04 -2017

                               

                              (Tecan)


                              (文章來源:hmez.huimeihealth.com.cn/hm/scrm/scrmmobile/eda/1654307552964694016



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