貝勒醫學院(Baylor College of Medicine)和合作機構的研究人員使用一種方法，包括整合來自10種癌癥類型的蛋白質組學、基因組學和表觀基因組學數據，已經確定了癌癥組織中的蛋白質和小蛋白質或肽靶點，并通過實驗驗證了其中許多作為治療策略的有希望的候選者。

這一發現發表在《Cell》雜志上。

貝勒大學萊斯特和蘇·史密斯乳房中心的分子和人類遺傳學教授Bing Zhang博士說:“經驗表明，靶向治療，即針對癌細胞中特定蛋白質的癌癥治療，有望比傳統的放療和化療取得更有效的臨床結果。”“盡管在識別特定癌癥類型的潛在脆弱性方面取得了進展，但fda批準的癌癥藥物針對的蛋白質不到200種。在這項研究中，我們通過分析來自10種癌癥類型的1000多個組織樣本的數據，大大擴展了潛在治療靶點的列表。”

研究人員應用計算工具整合蛋白質基因組學數據，包括DNA、RNA和蛋白質的全基因組信息，這些信息是由臨床蛋白質組學腫瘤分析聯盟(CPTAC)從前瞻性收集的treatment-na?ve原發性腫瘤樣本中產生的，其中許多與匹配的正常鄰近組織進行比較。該團隊將CPTAC數據集與其他公共數據集整合在一起，研究在不同腫瘤類型中發現的基因和蛋白質改變之間的異同，以闡明癌癥治療的蛋白質靶點。

“我們的目標是更好地了解已知藥物靶點的特征。我們也希望找到新的靶點，從而開發出新的藥物。”Bing Zhang說。

該團隊應用數據整合方法來識別對癌癥生長和發展重要的蛋白質和基因。他們還尋找腫瘤抗原，包括來自腫瘤基因突變的新抗原癌癥特異性肽。

Zhang說:“我們的研究揭示了重新利用目前批準用于其他疾病的藥物的新機會。例如，我們發現一種抗真菌藥物還可以減少幾種癌癥類型的生長，支持進一步探索這種藥物的抗癌價值。”

研究人員還發現了目前沒有藥物的潛在蛋白質靶點。Zhang說:“這些發現為藥物開發提供了機會，包括小分子藥物或藥物-抗體偶聯物。”

“我非常興奮，我們已經創造了一個全面的蛋白質靶點資源，通過確定許多新的候選者和涵蓋各種治療方式，顯著擴大了治療領域。我們已經在targets.linkedomics.org網站上公開了我們的發現。”“我們希望這一資源將為重新利用現有藥物和開發新的癌癥治療方法鋪平道路。”

參考文獻

Pan-cancer proteogenomics expands the landscape of therapeutic targets

（文章來源：mp.weixin.qq.com/s/jQsUHxirTFRtRZ3G8GwT1w）